近日，国家临检中心首次对DNA甲基化检测产品应用开展的全国性室间质量评价预研活动结果公布，测评涉及多家试剂厂商，信息量极大，详情请见如下分析。
本次预研是国家卫生健康委临床检验中心首次对DNA甲基化检测产品应用进行系统性检测，有利于各医疗机构/实验室更加了解各厂商DNA甲基化检测产品性能指标、进一步掌握甲基化检测方法，并加速推动DNA甲基化检测领域市场放量和发展。
DNA甲基化检测临床诊疗应用受到高度肯定，首次纳入国家临检中心室间质量评价预研
DNA甲基化是最早被发现且研究最深入的表观遗传调控机制之一，指在DNA甲基化转移酶的作用下，基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达，是早期癌症和癌前病变的重要信号。
目前，DNA甲基化相关肿瘤标志物被逐步应用于临床诊疗中。例如Septin9基因甲基化可以作为特定人群（如40岁以上，具有结直肠癌一般风险，且其已被提供过但未能完成常规便隐血加肠镜筛查的成年人，不分性别）筛查的标志物，以及MGMT基因甲基化可以作为高级别脑胶质瘤患者术后替莫唑胺化疗的决策及预后评估的标志物。此外，临床用于DNA甲基化检测的方法也较多，包括荧光PCR、PCR－基因芯片杂交、亚硫酸氢盐测序以及高通量测序等。
DNA甲基化在肿瘤临床诊疗的价值逐步得到认可：2022年5月，为了解我国各实验室DNA甲基化相关肿瘤标志物检测能力的现状，并为日后开展相关项目的室间质量评价活动做准备，国家卫生健康委临床检验中心首次对全国医疗机构临床实验室开展DNA甲基化检测室间质量评价预研。其中，结直肠癌早筛早检和脑胶质瘤术后化疗是国家癌症防治首要锚定点，所以率先开展Septin9和MGMT基因甲基化检测的室间质量评价预研。其中，在Septin9基因甲基化检测预研活动中，共计60家实验室反馈有效的Septin9基因甲基化检测质评结果。
Septin9基因甲基化检测室间质量评价中，实验室检查合格率为96.67%
本次预研，共计60家实验室反馈有效的Septin9基因甲基化检测质评结果，成绩分布如下：100分的实验室56家，90-99分（含90）的实验室2家，60-90分（含60）的实验室1家，低于60分（不含60）的实验室1家。按照≥90分为合格的标准，合格率为96.67%（58/60）。
实验室检测方法以实时荧光PCR为主（59/60），另有1个实验室采用靶向亚硫酸氢盐测序（1/60）。作为第二代PCR技术，实时荧光定量PCR（qPCR）为当前主流技术，该技术通过特异性荧光探针对指数期目的片段扩增荧光信号进行实时监测，同时实现了绝对基因表达和相对定量检测。
在DNA提取、亚硫酸盐转化、Bis-DNA纯化、甲基化检测等主要检测环节，博尔诚、透景、为真等厂商为实验室Septin9基因甲基化检测提供核心检测试剂。
检测试剂整体表现优异，博尔诚产品测试成绩最为突出
60家实验室中，56家（93.33%）实验室检出了所有的甲基化阳性样本，其余4家实验室报告了15个假阴性结果。各试剂厂商整体表现优异，总体阳性符合率为97.22%，总体阴性符合率为100%。
本次预研共涉及12家厂商的基因甲基化检测试剂产品，其中博尔诚、透镜、为真等8家厂商产品性能优异，阳性符合率和阴性符合率均为100%。
表1.各试剂检测结果[1]
a7种商品化Septin9基因甲基化检测试剂(实时荧光PCR法)；b4种实验室自建的Septin9基因甲基化检测试剂(实时荧光PCR法)；c1种Septin9基因甲基化检测(靶向亚硫酸氢盐测序法)
预研结果显示，半数的实验室（30/60）选择博尔诚旗下产品思博定®Septin9基因甲基化检测试剂盒，而且在检测最多样本的前提下，思博定®阳性符合率和阴性符合率均为100%，性能指标优秀且稳定。
DNA甲基化检测有望迎来规范化加速发展，各癌种DNA甲基化检测产品将迎来市场放量
本次全国DNA甲基化检测室间质量评价预研传递出几个信号：
一是DNA甲基化检测在癌症临床诊疗中的价值受到国家高度认可，有望迎来规范化加速发展。国家卫健委不仅开展了Septin9和MGMT基因甲基化检测的室间质量评价预研，又刚启动了SDC2基因甲基化检测的室间质量评价预研。在癌症诊疗方面，分子层面的DNA甲基化表观遗传检测应用愈发广泛，经过本次国家卫健委预研后，预计关于DNA甲基化的关注和讨论将逐渐增加，相关指南共识的出台和DNA甲基化检测技术路线的发展有望加速。
二是国家把结直肠癌等高发高危恶性肿瘤作为癌症防治的重点。结直肠癌（CRC）是全球范围内的高发恶性肿瘤之一，在我国CRC发病率和死亡率分别居恶性肿瘤的第2和第5位[2]；脑胶质瘤是由于大脑和脊髓胶质细胞癌变所产生的、最常见的原发性颅脑肿瘤，预后通常较差。预研活动中，Septin9基因甲基化是结直肠癌筛查的标志物，MGMT基因甲基化可以作为高级别脑胶质瘤患者术后替莫唑胺化疗的决策及预后评估的标志物。
三是各癌种的DNA甲基化检测产品将迎来市场放量。随着国家卫健委持续对各实验室DNA甲基化相关肿瘤标志物检测能力进行测评，DNA甲基化检测或将成为三级医院临检中⼼评级必需项⽬。自新冠疫情以来。各级医院逐步完成了PCR仪配备，PCR检测平台覆盖率大幅提升。本次测评中各实验室检测准确率均达到较高水平、甲基化检测操作技术规范性很高，表明现阶段我国DNA甲基化检测平台建设和检测技术规范性都已趋近完善。与此同时，本次预研活动反映出Septin9基因甲基化作为结直肠癌早筛早检标志物已在临床诊疗中被⼴泛应用及肯定，以博尔诚为代表的表现优异的厂商，其相同技术路线的消化道癌症早筛早检产品（如胃癌、⻝管癌等）进院的信任成本会大大降低，有望快速落地放量。
现阶段基于PCR技术平台的DNA甲基化检测产品，将成为癌症早筛早检主力军
现行癌症筛查方法，按照检测层级可以分为分子层面、细胞层面和组织层面。DNA包含最丰富的遗传信息，是分子层面首选检测对象，其中以DNA甲基化检测为代表的表观遗传学检测正逐步成为癌症早筛早检的主流技术路线。DNA甲基化异常出现时间早、容易通过ctDNA进行检测，对于乳腺癌、结直肠癌等癌种，DNA甲基化异常可能早于基因突变，是检测早期癌症或癌前病变的良好指征；而且DNA甲基化通常具有更高的组织和癌症类型特异性，不同部位癌症的甲基化位点特征也不同。
以基于PCR平台的血液Septin9基因甲基化检测为例，凭借着早期、精准、安全、方便等优点，在临床中应用愈发广泛。该检测仅需10ml外周血、采样便利、患者依从性好；对早期结直肠癌症检测灵敏度高，可达传统肿瘤标志物的5-10倍，极大地提高了早期癌症检出率；同时，PCR技术平台因其高性价比和相对优异的性能备受市场青睐，不仅适合于单个癌症和多种癌症联合早检，还可以进行疗效观察和复发监测。
应对癌症的优先级永远是预防大于治疗，如果能够早诊早治，大部分癌种通常并不致命。伴随着科技的发展和各类检测技术的不断进步，以及人民健康意识的不断提升，DNA甲基化等创新早检手段的渗透率有望持续提高，帮助更多受检者及早了解自身健康状况，推动癌症防治关口前移，共同攻克癌症这个世界性难题。
数据来源：
[1]国家卫生健康委临床检验中心,全国Septin9基因甲基化检测室间质量评价预研结果报告,2022.12.
[2]世界卫生组织国际癌症研究机构（IARC）GLOBOCAN2020数据.
