通过非侵入性的邮寄 DNA 采样,唾液采集器试剂盒正在改变遗传学和流行病学研究。本文探讨了 Oragene 套件与颊拭子等其他方法在 DNA 产量、质量、稳定性和易用性等关键指标方面的比较。
什么是唾液采集套装,为什么要使用它们?
唾液采集试剂盒是一种用于轻松、无创地采集唾液样本进行 DNA 分析的装置。它们在大型流行病学研究中越来越受欢迎,因为与传统的血液采集相比,它们具有多项优势。唾液采集简单、无痛,而且不需要训练有素的工作人员,因此可以很容易地从大量人群中采集样本或由参与者寄回样本。与抽血相比,非侵入性也提高了依从性和随访率。唾液中含有各种生物标志物和细胞,可用于评估 DNA 质量和产量,以便进行基因分型和其他基因分析。总之,唾液采集试剂盒简化了后勤工作,扩大了基因研究的可能性。
唾液采集方法的 DNA 产量如何?
一个关键的考虑因素是不同的采集方法和试剂盒在下游 DNA 分析中的表现如何。研究将奥拉基因唾液试剂盒的产量与其他非侵入性技术(如颊拭子、细胞刷、口腔冲洗和被动流口水)进行了比较。Oragene 套件的总 DNA 产量一直最高,每个样本的中位数约为 110-180 μg,是其他方法的 3-12 倍。例如,在一项对 17 名成人进行的交叉研究中,Oragene 唾液的中位产量为 181 μg,而口腔漱口水为 36 μg,拭子和刷子为 10-13 μg。Oragene 的高产率归功于其稳定缓冲液,它能溶解细胞并防止降解。口腔冲洗液和口水的表现也相当不错。不过,细胞刷和颊拭子提供的 DNA 通常不足以满足微卫星基因分型等应用的需要,因此需要每个受试者使用多个拭子。总的来说,Oragene 唾液和口腔漱口水的 DNA 产量最高,也最稳定。
不同采集方法的 DNA 质量如何?
除了总产量,DNA质量对基因分型的准确性也至关重要。重要的指标包括纯度比(如 A260/280 和 A260/230)、PCR 成功率和凝胶电泳的完整性。同样,Oragene 唾液和口腔漱口水的结果最好,A260/280 比率在理想的 1.7-1.8 范围内,表明蛋白质污染较少。颊拭子和刷子的结果较差,纯度比低得多,表明污染程度较低。奥拉基因唾液的 PCR 扩增率为 99%,口腔漱口水的 PCR 扩增率为 98%,明显高于细胞刷和拭子的 75-84%,因为细胞刷和拭子在扩增较长的扩增子时会出现问题。Oragene 稳定试剂似乎是在室温下保持 DNA 完整性和纯度的关键。就产量和质量而言,Oragene 唾液和口腔冲洗液都优于颊拭子。
样本采集方法如何影响唾液流速?
一个重要的变量是采集方法如何影响唾液流速和总蛋白水平,这可能会影响分析物浓度。被动口水和拭子的非刺激流速最低,约为 0.5 毫升/分钟。拭子和刷子的机械刺激流速较高,为 1-1.5 mL/min。Oragene 的柠檬酸缓冲液因其 pH 值呈酸性,流速最高,约为 2.5 mL/min。不同方法的总蛋白水平差异不大,但 Oragene 方法的总蛋白水平较低,这可能是因为它的高流量稀释了蛋白质。研究人员应根据所需的流速和分析物浓度进行标准化采集。
奥拉金唾液的室温储存耐受性如何?
奥拉金唾液的一个关键实用优势是,由于它采用了生物稳定缓冲液,因此在室温下可长期保持稳定。研究发现,在室温下保存长达 8 个月的 Oragene 样品中,DNA 产量和质量都没有下降。即使在室温下保存 8 个月后,A260/280 纯度比仍然理想,PCR 扩增率也达到 98-99%。这与口腔冲洗DNA在未保存10天后就会降解形成鲜明对比。Oragene 的稳定性简化了大型远程研究的样本采集、储存和运输。不过,如果要保存一年以上,可能仍然需要冷冻,以防止干燥。总的来说,Oragene 的缓冲液可在室温下保持 DNA 的产量和质量至少 8 个月。
唾液采集方法有哪些局限性?
虽然唾液采集有很多优点,但也有一些局限性需要考虑。紫外分光光度法等定量方法无法区分微生物和食物残渣中的人类 DNA 和非人类 DNA。唾液产量也会随年龄、性别、水合状态和其他因素而变化。唾液分析物的昼夜变化还没有得到很好的描述。最后,现场采样与上门采样可能会产生不同的参与率和返回率,这对可行性非常重要。对这些参数的更多研究将优化大型流行病学生物库研究的方案。
总之,唾液采集试剂盒提供了一种非侵入性方法,可为基因分型和生物库研究获取高质量的 DNA。与抽血相比,唾液采集拓展了基因流行病学研究的可能性。Oragene 试剂盒在产量、纯度、稳定性和易用性等关键指标方面表现良好。口腔冲洗也有很好的表现,但颊拭子和刷子有其局限性。标准化和优化采集方法对于最大限度地提高人口基因组学的 DNA 质量和参与率至关重要。
References
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