上呼吸道标本的采集
①鼻咽拭子采集：使用扩鼻器，先用一个拭子拭去鼻黏膜表面的分泌物并丢弃，再用第二个拭子蘸取无菌生理盐水，插入鼻孔采集病灶标本。
②口咽拭子采集：采集标本时患者先用清水漱口，由检查者将患者舌向外拉，使其腭垂尽可能向外牵引，用无菌的拭子由口腔进入，越过舌根到咽后壁或腭垂的后侧，采集鼻咽红肿处标本，取材后小心将拭子退出，立即放入无菌试管内。若咽部肉眼可见明显发红或有假膜存在，应在局部擦拭取标本(最好拭子从膜底下擦拭)。
下呼吸道标本的采集
①自然咳痰法：以晨痰为佳，用冷开水反复漱口后用力咳出第一口痰。对于标本采集痰量少或无痰的患者可进行诱导咳痰，即采用雾化吸入加温至45℃的100g/L
NaCl溶液，使痰液易于排出。将痰采集于无菌容器中尽快送检。
②支气管镜采集法：用支气管镜在肺内病灶附近用导管吸引或用支气管刷直接取得标本，尽可能避免咽喉部正常菌群的污染。
③胃内采痰法：清晨空腹时，将胃管插入胃内，用注射器抽取胃液。该方法适用于无自觉症状的肺结核患者，尤其是婴幼儿不会咳嗽，常将痰吞咽入胃，可采集胃内容物做结核分枝杆菌培养，其阳性率比咳痰高10%左右。
④人工气道采痰法：通过气管切口插管，负压吸引取得痰液，可用于厌氧菌培养。
⑤小儿取痰法：用弯压舌板向后压舌，将棉拭子伸入咽部，小儿经压舌刺激咳痰时，可喷出肺部或气管分泌物粘在拭子上，送检。对幼儿还可用手指轻扣胸骨柄上窝，刺激气管以诱发咳痰
呼吸道标本送检的注意事项
(1)标本采集后需尽快送至实验室，不能超过2h。不及时运送可导致肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等苛养菌由于自溶现象和不适应外界环境而死亡。
(2)不能及时送达或待处理标本应置于4℃冰箱保存(疑为肺炎链球菌和流
感嗜血杆菌等苛养菌除外)，不能超过24h，以免杂菌生长。
(3)对可疑烈性呼吸道传染病的患者检验标本，在采集、运送或保存过程中必须注意生物安全防护。
